一、平台简介

1.1平台发展历史

甘肃省胸部疾病临床医学研究中心成立于2021年，是在紧密围绕医学科技发展需要和国家重大急、慢性疾病防控需求下，充分发掘胸部疾病临床医学研究中心的研究优势和基础，结合自身特色，建立胸部疾病领域防治一体化的研究体系，以“强调创新，注重临床；统筹规划，整体布局；加强转化，扩大推广；强化管理，完善机制”为建设原则，重点加快西北地区胸部恶性肿瘤生物样本库建设，规范早诊早治体系，深入贯彻精准医疗理念，推动优质医疗资源下沉。

1.2平台负责人

苟云久

医学博士，教授，主任医师，硕士研究生导师，中共党员。甘肃省领军人才，甘肃省卫生健康行业骨干人才，甘肃省优秀医师，共青团中央 20 届青年文明号号长。

现任甘肃省胸部疾病临床医学研究中心执行主任，甘肃省省级医疗重点学科主任，达芬奇手术机器人中国胸外科临床教学手术示范中心主任，甘肃省人民医院胸外科一病区主任。

担任海峡两岸医师协会胸外科分会常委、中国医师协会医用机器人医师分会常委、中国医师协会胸外科分会青年委员、中国医师协会胸外科分会快速康复委员会委员、中国抗癌协会纵隔肿瘤专委会委员、甘肃省医学会胸外科分会委员兼秘书、甘肃省抗癌协会食管癌专业委员会副主任委员、甘肃省抗癌协会小细胞肺癌专业委员会副主任委员。

主持并参与国家级、省部级科研课题10余项；以第一或通讯作者发表国内外论文60余篇，其中SCI论文20余篇；荣获甘肃省科技进步奖1项，甘肃省医学科技奖1项。

 

1.3特色设备或实验技术

①特色仪器设备

 

 

 

 

②试验技术

基因组学研究平台

基因组学研究是以分子生物学理论为基础，研究体内遗传物质的结构或表达水平的变化而做出的、或辅助临床诊断的技术，为疾病的预防、预测、诊断、治疗和转归提供信息和决策依据。基因组学平台配置有荧光定量PCR仪、数字PCR仪、一代测序仪、高通量基因测序仪、液相基因杂交仪、FISH原位杂交仪、基因芯片仪等高新设备。开展针对个体化医疗、药物基因组学，肿瘤分子靶向治疗为核心的基因诊断及研究项目。 

PCR实验平台

研究所PCR实验平台现配制数字PCR仪1台、荧光定量PCR仪6台，普通PCR仪6台；平台可实现多重PCR(multiplexPCR)、巢式PCR（nestedPCR）、反转录PCR（reversetranscription PCR）和实时荧光定量PCR和数字PCR（digitalPCR）等相关技术的开展。平台重点职能主要包括：

l 传染性疾病核酸检测

l 肿瘤个体化诊疗相关基因检测

l 遗传性疾病基因诊断

l 药物代谢基因组学检测

l 基因表达图谱分析

l 表观遗传相关分析

基因测序平台

基因组测序平台拥有一代、二代测序仪，包括毛细管电泳测序仪3500DX，二代DA8000高通量测序仪及Illumina Hiseq550DX高通量测序仪。平台拥有超过1000平米的专业分子生物学实验室，可完成不同分子水平的前期文库构建及上机检测等工作。

Applied Biosystems公司生产的3500DX毛细管电泳测序系统，主要特点为读长长、通量低、准确性高，可同时分析16个样品，采用4色荧光同时检测，可不间断24h运行，自动完成灌胶，上样，电泳分离，检测及数据分析，应用灵活而广泛。适合低通量克隆测序、PCR产物测序、STR扫描等，是基因测序验证的金标准。

DA8000高通量测序仪是Life Technologies公司推出的基于半导体检测技术的测序系统，通过检测DNA聚合酶反应过程中释放的H+离子，读取DNA序列信息，具有通量高（10-30Gb/run），200bp读长，SNP检测准确性高、运行速度快等特点，适合于基因组重测序、外显子组测序、转录组测序研究等。

Hiseq550DX高通量测序仪是Illumina公司生产的新一代高通量测序系统，是通量较高、应用最广泛的测序平台，一个Run可产出200Gb以上数据、准确性高、可双端测序等特点，适用于基因组重测序、基因组de novo测序、外显子组测序、转录组测序、小RNA测序、降解组测序、甲基化测序、ChIP-SEQ测序。

分子杂交平台

荧光原位杂交技术（Fluorescence in situ hybridization，FISH）是在细胞遗传学水平上检测染色体及基因数目及结构异常的一种分子生物学技术。研究所配备有ThermoBrite荧光原位杂交仪和OLYMPUS-BX53成像系统，具有直观、快速、敏感性高和方便灵活等特点，目前已经广泛应用于临床的肿瘤遗传学及各种基因相关疾病的分型与个体化治疗等多个研究和临床诊断领域。

基因芯片又称DNA芯片(DNA chip )或DNA微阵列(DNA microarray)。是采用光导原位合成将大量特定序列的探针分子密集、有序地固定于经过相应处理的硅片、玻片、硝酸纤维素膜等载体上，然后加入标记的待测样品，进行多元杂交,通过杂交信号的强弱及分布，来分析目的分子的有无、数量及序列，从而获得受检样品的遗传信息。研究所配备有BaiO-BR-526-24基因芯片仪及TL998分子荧光检测仪，应用已知核酸序列与互补的靶序列杂交，根据杂交信号实现了对目标序列的定性与定量分析，已经应用于诊断肿瘤、心脑血管疾病等复杂疾病精准医疗相关基因检测。

 

细胞生物学研究平台

细胞生物学已经成为当前生物科学的基础学科。特别是后基因时代的到来，生命科学将从分子水平回归细胞水平完成自20世纪50年代以来的第二次飞跃，即后基因时代的“细胞计划”。“细胞计划”将从分子水平到细胞水平进行全方位二维研究，有望在细胞分子领域取得一系列重要进展与突破。同时，随着生物细胞实验技术的发展，干细胞研究在药物筛选、新药开发，移植治疗、胚胎发育、疾病发生及遗传性疾病研究领域具有极为广阔的前景。近年来该领域取得了突破性进展，已广泛深入地开展了用来治疗多种疾病的“干细胞生物工程”。为了我院临床研究与基础研究建立起高效的转化研究体系，针对细胞生物学研究，研究所建立了以下几个高新技术平台。

细胞培养平台

细胞培养与检测平台以细胞生物学实验为基础，包括细胞培养、形态观察和成像、细胞化学指标检测、细胞分子生物学等常规实验检测指导和研究服务平台。平台建有细胞培养室5间，占地162平方米，可同时容纳30人进行细胞培养操作。设备先进齐全，主要的仪器设备有：　超净工作台、二氧化碳培养箱、三气培养箱、倒置显微镜、倒置荧光显微镜、体视显微镜、恒温培养摇床、台式多功能低温离心机、酶标仪、分析天平、超声破碎仪、电热干燥箱、高压灭菌锅、储存式液氮罐、超纯水机等。细胞培养平台可实现人源及动物原代细胞培养及传代单层培养、细胞微球培养、细胞三维立体培养、慢病毒包装与转染、肿瘤干细胞分选及培养研究等。

激光共聚焦成像分析系统

激光共聚焦扫描显微镜（Confocal laser scanning microscope，CLSM）是在荧光显微镜成象的基础上加装激光扫描装置，使用紫外光或可见光激发荧光探针。利用计算机进行图象处理，从而得到细胞或组织内部微细结构的荧光图象，以及在亚细胞水平上观察诸如钙离子、pH值、膜电位等生理信号及细胞形态的变化。

研究所配置的德国莱卡SP8激光共聚焦显微镜具有高分辨率、高灵敏度、“光学切片”、三维重建、动态分析等优点，为基础医学与临床医学的研究提供了有效手段。同时，该仪器既可以用于观察细胞形态，也可以用于细胞内生化成分的定量分析、光密度统计以及细胞形态的测量, 配合焦点稳定系统可以实现长时间活细胞动态观察，可实现组织和细胞中的定量荧光测定、细胞间通讯的研究、细胞物理化学测定、细胞内钙离子和 pH 值动态分析、细胞三维图像的重建、荧光漂白恢复、长时程观察细胞迁移和生长等。

高内涵显微镜成像分析系统

高内涵细胞成像定量分析系统，也被称为高内涵筛选(high content screening, HCS)或高内涵分析(high content analysis, HCA)，是一套综合了高通量显微镜成像和大数据定量的自动化分析方法。在一次实验中同时获取细胞（组织或生物体）的明场或荧光显微成像，多重靶标分子表达量，时间和空间信息，细胞与亚细胞形态结构信息，通过高内涵图像分析软件定量分析靶标和表型数据，综合获得细胞群体的相关生物学特征。

研究所配备的OLYMPUS-ScanR高内涵显微镜成像分析系统可以实现自动化高通量细胞和组织显微镜成像、明场及荧光成像，宽场和共聚焦成像、同一实验多参数（多标记）、多维度（时间、空间等）数据定量分析、细胞个体或者群体靶标分析定量检测和表型定量检测、大数据生物信息学分析，能对细胞形态、生长、分化、迁移、凋亡、毒性、代谢途径及信号转导等方面进行定量分析。

流式细胞检测分选平台

流式细胞术（Flow CytoMetry，FCM）是对悬液中的单细胞或其他生物粒子,通过检测标记的荧光信号，实现高速、逐一的细胞定量分析和分选的技术。具有测量速度快；可进行多参数测量；综合了光学、电子学、流体力学、细胞化学、免疫学、激光和计算机等多门学科和技术等特点。FCM已普遍应用于免疫学、血液学、肿瘤学、细胞生物学、细胞遗传学、生物化学等临床医学和基础医学研究领域。

研究所拥有BD-FACSAria II流式分选仪、BD-FACSCalibur及BD-Accuri C6 Plus流式细胞仪，实现了以下临床及科研服务：

l 细胞分选：造血干细胞，免疫细胞，周期细胞等分选；

l 细胞周期：全周期分析、G1期分析、S期分析、M期分析；

l 细胞表面及胞内蛋白分析：免疫细胞分型、干细胞分析、其它表面及细胞内蛋白分析；

l 细胞功能：如死亡、凋亡、抗药性；

l 基因表达：内源及外源基因表达。

 

蛋白及代谢组学研究平台

随着人类基因组计划的逐步完成，生命科学进入了以蛋白质组及代谢组研究为核心的后基因组时代。研究所搭建的蛋白及代谢组学研究平台配备有纳升级LC超高分辨质谱联用系统、代谢组学分析系统、Western Blot蛋白免疫印记平台及Luminex多因子液相芯片技术平台。蛋白及代谢组学研究平台可通过比较细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达及代谢产物的异同，对相关蛋白质及代谢组进行分类和鉴定，同时对蛋白质间相互作用和蛋白质的功能进行分析，为疾病发病机理的阐明提供理论根据和解决途径。

纳升级LC超高分辨质谱联用系统

由EASY-nLC 1200系统和Q Exactive质谱仪组成。EASY-nLC 1200系统是赛默飞公司最新一代纳升级LC系统。该系统具有在更高高压（1200bar）条件下分离生物分子（比如蛋白质和肽）的独特性能。先进的设计使其通过更高的压力以及微珠尺寸和柱长的变化，使蛋白质和肽的识别率提高10%。Q Exactive质谱仪将四极杆母离子选择与高分辨率准确质量数（HRAM）Orbitrap 检测相结合，不但可以提高传统质谱数据的准确性，更可以提供样品形态等结构信息，特别适用于非目标或目标化合物筛查，也能够实现广泛的定性和定量应用，在蛋白质组学、蛋白质的相互作用以及蛋白质复合物分析等方面有着广泛的应用空间。主要适用于：

l 未知蛋白/肽段的高通量鉴定、测序；

l 蛋白质翻译后修饰位点和结构的高通量解析；

l 蛋白质相互作用鉴定；

l 未知蛋白及未知突变分析；

l 高通量蛋白质差异比较、疾病标志物和药物靶标发现；

l 目标蛋白质高通量验证、绝对定量。

代谢组学分析系统

配备Vanquish Duo UHPLC系统，与Q Exactive高分辨质谱仪进行联用，使用原质谱软件进行反控，实现前端代谢组色谱分离分析，使目标物分段进入到高分辨质谱仪进行数据分析，配套组学解析软件进行定性、定量工作。可同时分析数百种代谢物和脂质，而不会影响分析通量，实现了基于同位素标记的内标的定量和化合物的鉴定。

Vanquish Duo UHPLC，双LC工作流程可以实现在一次分析中实现极性代谢物和非极性脂质高通量组学分析，提高分析效率，为极性/非极性兼容分析提供了新的分析手段，助力代谢-脂质组学研究方法新突破。适用于代谢物鉴定、研究与疾病有关的标记物和代谢组学、脂质组学等研究领域。

Western Blot蛋白免疫印记平台

Western Blot蛋白免疫印记平台包括Jess全自动蛋白表达分析系统，蛋白电泳、转膜系统，微孔板分光光度计（酶标仪），凝胶成像系统。开展的相关技术服务有：

l 蛋白质与蛋白质相互作用关系，包括免疫共沉淀（Co-IP）,GST pull-down实验、酵母双杂交系统筹；

l 蛋白质与基因相互作用关系，包括ChIP、电泳迁移率实验（EMSA）等；

l 蛋白质检测，包括蛋白质免疫印迹（Western blot）、ELISA检测等。

Luminex多因子液相芯片技术平台

Luminex多因子检测是基于微球检测原理，覆盖分析物种类最多且可自由搭配分析物种类的检测手段。它可用于细胞培养上清液、血清或血浆等多种样本的蛋白定量，可以实现对细胞因子、激素、自身抗体、肿瘤标志物等的检测，被广泛应用于基础和临床相关研究。

研究所目前拥有Luminex 200多功能液相芯片系统结合了磁珠/非磁珠多重反应体系、分析软件和技术支持，提供了一个快速、精确的生物标记定量平台。平台能够在一份微量样本(10-50μl)中检测多达100重生物标志物，应用领域包括自身免疫研究、肿瘤研究、心血管疾病研究、糖尿病与代谢病研究、信号通路研究、基因突变研究、HLA配型研究、HPV分型研究等众多领域。

 

二、科研概况

2.1科技成果奖励

    

 

2.2专利