需使用清洁、有盖、一次性的容器进行尿液采集，采集尿液的量一般大于20mL。需不需要空腹留尿，具体情况需要根据尿液标本类型决定。尿液标本类型如果是晨尿，在留尿的时候最好空腹。

在采集尿液的过程中，应留取中段尿，避免留取前段或者后段的尿液，以免影响化验的结果。如果没留取中段尿，有条件建议重新留取中段尿。在留取尿液过程中，尽量避免白带、精液和粪便等污染。

做尿常规项目时应取晨尿或随机尿。晨尿是早晨5点至6点留尿（由于时间因素，一般建议7点左右），有利于检测 HCG、血细胞、上皮细胞、病理细胞、管型等有形成分。随机尿就是没有规定特定时段直接接尿入试管中即可，随机尿受多种因素影响，特别注意的是女性应在月经期干净后 2~3 天检查，以避免因月经影响相关检查结果；采集时应避免在患者大量服药汁、大量饮水、汤或饮料后。

做尿培养项目时需要采用无菌留取尿液的方法，也就是留取的尿液标本不能被周围的细菌污染了，目的是看尿液里有无细菌，需要护理人员参与方可完成。最常用的方法是取中段尿，方法是：首先，患者清洗外阴，护理人员消毒外阴和尿道口，患者排尿弃去开始排出的尿。

在留取尿液后应在两小时内尽快送检。

大便应挑取约花生米大小一块新鲜粪便装入标本容器，采取标本后1小时内送检。如大便有粘液脓血等异常外观时，必须挑取有粘液、脓血或其他异常外观的部分送检。粪便标本不应用卫生纸包裹，请直接装入不吸水的便盒内，以防水分丢失、细胞被破坏。

标本中不可混有尿液，更不可从尿壶、尿不湿中采取粪便标本，因为尿液可使粪中柔弱的原虫致死，能使粪中胰蛋白酶活性检查结果增高。

应避免混入水等其他物质，以免破坏有形成分，使病原菌死亡。粪便标本中也不可混入植物、泥土、污水等，因为腐生性原虫、真菌孢子、植物种子、花粉易混淆实验结果。

如有隐血试验，应避免在检验前3天服用大量维生素C，禁食动物性食物、血类食品，并禁服铁剂、铋剂，避免混入经血、尿液。如口鼻出血有过吞咽，也会影响结果，并且需要连续送检3天。