《灵枢·根结》首先提出“命门”一词，《难经》将命门作为一个凌驾于脏腑经脉以上的器官加以阐述。

但《难经》之后，汉、晋、隋、唐、宋之医籍，基于《难经·三十九难》“命门……其气与肾通”之说，多以“肾气”代替命门功能，很少阐述命门的作用。

直到明代温补学派根据《难经》之论对命门学说大加发挥，诸家对命门所在部位虽有不同见解，但对其功能及其重要性的认识则是一致的。

由于温补学派对肾与命门学说的深人阐发，把中医辨治杂病的水平提高到了一个崭新阶段。

然而，到了近现代，命门学说又有被轻视、忽视的倾向，如《中国百科全书·中医基础理论》认为，“肾阳亦即命门之火”，把命门附在“肾”的条目之中作简单介绍，在病机条目中也根本没有命门病机。

“命门”是人体独立的功能单位。

《难经·三十六难》“命门者，诸精神之所舍，原气之所系也，故男子以藏精，女子以系胞”，其《八难》指出“肾间动气者，人之生命，五脏六腑之本，十二经之根，呼吸之门，三焦之原”，认为命门即肾间动气。

《命门图说》中说：“命门乃两肾中间之动气，非水非火，乃造化之枢桓，阴阳之根蒂，即先天之太极，五行由此而生，脏腑以继而成。”

张景岳在《类经附翼·三焦、包络、命门辨》中做了进一步阐述：“命门总主乎两肾，而两肾皆属于命门”。

称命门为“真阴之脏”，其所藏之元精为“阴中之水”，元精所化之元气为“阴中之火”，正由于命门藏精化气，兼具水火，故“命门为水火之府，为阴阳之宅，为精气之海，为生死之窦”，又称命门为“精血之海”、“元气之根”。编辑道家绳疗。

由上面论述可知，命门是一个比肾更高层次的器官，主要是藏有先天之元精，并不断化生元气，而成为生命活动的原动力。

景岳所谓“命门与肾本同一气”实指命门元精所化之元气充于肾而为肾气，所谓肾精则是后天五脏剩余真精所藏，对命门元精有滋养作用。

至于命门的病理则主要表现为命门火衰，实际是真阴元精不足，故景岳在《质疑录》中说：“无水无火，皆在命门，总曰真阴之病。”

赵献可《医贯》也说：“命门君主之火，乃水中之火，相依而永不相离也”，并用了一个著名的比喻表明命门水火功能——走马灯，再恰当不过了，说：“火旺则动速，火微则动缓，火熄则寂然不动……”。

灯中之油喻命门元精（水），火焰喻命门之火，油足则火焰旺，走马灯转动快，即生命富有活力；油少则火焰低落，走马灯转动缓慢，即生命活力低下，可见火焰旺与不旺的关键在油足与不足。

因此，命门火衰的实质是元精亏虚，故治疗命门火衰，只辛热温阳是不够的，应重在填精。

命门火衰的辨治，命门火衰影响范围大，涉及多脏腑多层次的功能衰退，而尤以“男子以藏精，女子以系胞”的功能减退为突出。

命门火衰，火不温土则脾胃运化失司，而有纳差、食不化诸症；火不温肾，则肾阳虚而水不化，可发生浮肿诸症；火不暖肝，则肝阳升发不足，而有怯弱、疲乏、痿软诸症；命门火衰则心阳不振，血脉不温，血流瘀缓，精神萎靡；命门火衰也必然导致肺卫阳虚，卫外不固，易致客邪入侵，引发种种外感合并症。

命门火衰源于元精不足，“精以化血”和“精以化气”之功能低下，又必定引起气虚血虚诸症。道家绳疗提示命门火衰之时，男子藏精、女子系胞的功能低下，而引起阳痿、不育、不孕和月经停闭诸症，则是最常见的病变。

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