红蓝光治疗仪的原理是通过使用特定波长的光激活痤疮丙酸杆菌代谢的卟啉，红蓝光治疗痘痘通过光毒性反应促进皮损自愈来达到治疗痤疮的目的的一种治疗方法。

一、红光主要作用于激活人体自身的代谢机能，产生一系列复杂的生物效应。红光照射治疗时，光子能量被细胞线粒体大量吸收，产生一系列的光化学反应，使线粒体中的过氧化氢酶（CAT）、超氧化物歧化酶（SOD）等多种酶的活性得到激发，促进ATP的利用和蛋白质的合成，从而促进细胞新陈代谢，提高组织细胞的呼吸作改善微循环利局部营养，如速肉芽组织生长、创面愈金。与药物、邀光、紫处线、超真速及一切热用地、（如红处线、敬波等）治疗定全不回，对生物体有益无害：无毒副作用，不与地疗药物无：思者无不适感，安全可靠。
二、蓝光主要作用于靶细胞，产生显著的杀灭痤疮丙酸杆菌作用，痤疮丙酸杆菌感染是痤疮发生的重要原因之一。用高功率的蓝光照射治疗，光子能量被痤疮丙酸杆菌大量吸收，并激活细菌内源生成的光敏剂叶啉，经过光化学反应转换成毒性单态氧，迅速杀死痤疮丙酸杆菌，从根本上消除痤疮的致病因素。
蓝光结合高能红光照射治疗，可以减少炎症的产生、显著促进炎症的康复，同时减轻了与痤疮损害有关的红斑反应，减少了痤疮疤痕的形成。另外，混合光照射治疗，可以明显促进皮肤胶原蛋白的生产，使痤疮损伤部位皮肤恢复平滑。