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目前,下呼吸道感染已成所有感染性疾病主要死因,感染病原体涉及细菌、真菌、分枝杆菌等多种类微生物,同时不同病原体引起的临床症状、肺部影像大同小异,导致临床鉴别困难。
以肺部感染所致肺空洞为例,分枝杆菌(TB及NTM)、曲霉属、肺孢子菌、隐球菌属、马尔尼菲蓝状菌、诺卡菌属等多种微生物在影像学上都能导致肺部空洞性改变,在患者没有其它特异性临床表现的前提下,很难做出准确判断。
若采用经验性治疗,则可能导致治疗不足与治疗过度,或治疗失败,患者及医疗机构负担重,同时抗菌药物的广泛使用导致细菌耐药问题日益突出。因此对于感染病原体的快速诊断,及时提供药物耐药信息是精准治疗的基础。
产品介绍
RDseq-呼吸感染症候群基因检测及耐药基因鉴定产品,采用MultiCap专利多重捕获技术及酶化学联合机械研磨高效破壁技术,最大程度提取样本中全部微生物核酸。基于三代纳米孔测序技术后与专项数据库进行比对分析,获得样本中微生物种属信息。同时基于自主知识产权的耐药基因数据库,实现常见抗生素耐药基因及一二线抗结核药物耐药基因全覆盖。
检测内容
病原体鉴定范围
1)12000+种呼吸道感染相关细菌、真菌、病毒等微生物(不包括RNA病毒)
2)针对结核分枝杆菌、168种非结核分枝杆菌和真菌,特异性捕获进一步提高敏感度
耐药基因检测范围
1)10种与常见抗生素相关的耐药基因
2)20种与结核一二线药物相关的耐药基因
3)7种与非结核药物相关的耐药基因
覆盖耐药基因
(1)结核/非结核药物及相关耐药基因
(2)常见抗生素相关耐药基因
检测性能
RDseq在肺泡灌洗液中的MTB检测下限
为确定RDseq在肺泡灌洗液样本中对针对MTB的最低检测限,我们将已知浓度的结核分枝杆菌标准菌株与结核分枝杆菌复合群阴性的肺泡灌洗液样本进行混合,并进行梯度稀释液来确定最低检测限,每个梯度进行了超过20次的重复检测,将具有95%阳性检出率的菌株浓度作为最低检测限。经过验证性实验,RDseq在肺泡灌洗液标本中针对结核分枝杆菌的检测下限为100copies/ml,耐药基因检测灵敏度为1000 copies/mL。
产品优势
01 时效快速:收到合格样本后稳定20小时内出具检测报告
02 鉴定更准:专门针对结核分枝杆菌、非结核分枝杆菌、真菌等引起肺空洞的病原菌特异性捕获,结合独有破壁技术以及纳米孔测序超长读长,灵敏度更高
03 耐药基因位点全覆盖:独有的26种抗生素+结核一二线药物耐药基因检测,覆盖37个基因全外显子,可检测超过30000个位点,包含点突变、缺失、插入、重复等多种变异形式
样本要求
应用场景
(1)呼吸系统感染,尤其是急性下呼吸道感染亟需明确病原体的患者
(2)临床结核分枝杆菌抗菌治疗效果不好和疑似结核分枝杆菌耐药的患者
(3)可在用药前检测,指导精准治疗,减少经验用药
(4)可用于医院感染控制与感染细菌耐药性监测
案例分享
● 入院病史
男性患者,57岁,发热、咯血,肺部出现空洞性改变,怀疑真菌或结核感染,取肺泡灌洗液样本送检。
● 检测结果
收样后20小时内出具检测报告,检测结果提示结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex)、耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jirovecii)混合感染。同时检出利福平、乙胺丁醇药物相关高突变耐药基因。
● 临床意义
临床结核培养结果未出,真菌G试验和GM试验结果均为阴性。RDseq检测结果提示结核分枝杆菌和真菌双重感染,同时医院结合耐药基因检测结果调整患者治疗用药。23天后医院肺泡灌洗液培养结核阳性,患者针对性用药后肺部病灶明显好转。
圣庭医疗介绍
圣庭医疗由A股上市企业天宇股份(300702)和哈佛大学博德研究院资深科学家联合创办。公司依托三代纳米孔测序这一前沿基因检测技术,经多年研发及临床转化开发了思可愈Seq&Treat™病原微生物快速检测方案及TBseq结核/非结核分枝杆菌鉴定及耐药基因检测、RDseq-呼吸感染症候群基因检测+耐药基因鉴定服务,旨在为医疗机构提供更触手可及的临床感染诊断解决方案。
思可愈Seq&Treat™是圣庭基于自主开发的专利捕获技术MultiCapX,结合第三代纳米孔测序平台开发的新一代病原感染诊断产品,覆盖了包括细菌、真菌、DNA/RNA病毒在内超过20000+病原体。目前已经和国内多家三甲医院开展了密切的临床科研合作。
TBseq经过3年的研发优化及数据库积累,已与国内多家三甲医院及科研机构开展合作,以”终止结核流行,促进健康呼吸“为己任,致力于成为我国结核病防治工作领跑者。
圣庭一直秉承“急你所疾,精准洞见”的感染医疗服务理念,并与全国多家医疗单位、科研院所等机构展开了密切的合作,立志打造基因检测和精准定制化解决方案的高科技企业
杭州圣庭医疗科技有限公司
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