腹泻病毒标本的采集与处理基本过程如下：

（1）用于直接检测病毒的粪便标本，发病后应立即采集，将几克粪便标本盛于清洁的塑料或玻璃容器内，密封后送往实验室。

（2）水样便可用吸管吸至塑料或玻璃容器内，密封后送实验室。

（3）从腹泻患儿尿布中采集的粪便可以通过几种方式进行处理：

可以将尿布上面平铺一层塑料布，或者翻转一次性尿布使塑料面贴在儿童皮肤上以免腹泻的粪便浸入尿布；另一种方法是，可以用木质的压舌板从尿布中刮取部分腹泻的粪便，或者剪下一片尿布，将剪下的尿布浸在无菌的水中或者磷酸盐缓冲液中。有时也使用经十二烷基硫酸钠-EDTA处理的色谱纸条来收集、转运和储存粪便标本。

用于核酸扩增，粪便标本中经常存在抑制PCR反应体系中酶的活性的物质，妨碍病毒核酸的检测，最简单的方法就是将粪便稀释成10％ 的悬液后进行后续实验。

为了提高病毒的稳定性，经常会将培养基、防腐剂、胎牛血清或者洗涤剂加到其他用于病毒诊断的临床样本中，但是这些物质会干扰某些用于腹泻病毒的检测方法（例如酶联免疫实验和乳胶凝集试验）的准确性，所以不应该加在粪便标本中。标本一旦送达实验室，就应该储存在4 ℃，在此温度下可以放置几天至数周。需要长时间放置的标本应该冷冻储存，最好在-70 ℃，但是某些抗原检测试剂盒提示-20 ℃冷冻也可接受。