指甲上有黑色短小细线可能是甲营养不良、外伤、甲真菌病、微量元素缺乏、贫血等因素，需要针对病因治疗，可采取的方法有补充营养、处理外伤、抗真菌治疗、补充微量元素、改善贫血等。

1. 甲营养不良：甲营养不良会影响指甲正常生长，导致出现黑色短小细线。日常要注意饮食均衡，多吃富含蛋白质、维生素及矿物质的食物，如鸡蛋、新鲜蔬果等，保证指甲生长所需营养，一段时间后观察指甲变化情况。

2. 外伤：指甲受到挤压、碰撞等外伤，可能使甲下毛细血管破裂出血，形成黑色细线。轻微外伤可先冷敷减轻肿胀疼痛，24小时后热敷促进淤血吸收；若外伤严重，出现指甲松动等情况，需及时就医，由医生处理伤口，避免感染影响指甲恢复。

3. 甲真菌病：皮肤癣菌等真菌感染指甲引发甲真菌病，可能出现黑色细线。遵医嘱外用盐酸阿莫罗芬搽剂、硝酸咪康唑乳膏、联苯苄唑乳膏，按说明书规范涂抹于病甲，坚持使用直至症状消失且真菌检查转阴。

4. 微量元素缺乏：身体缺乏铁、锌等微量元素，会干扰指甲正常代谢。可通过食物补充，如吃瘦肉、动物肝脏补铁，吃海鲜、坚果补锌；也可遵医嘱服用葡萄糖酸锌口服液、多维铁口服溶液、碳酸钙D3片，定期复查微量元素指标。

5. 贫血：贫血导致指甲缺乏充足血液供应，可能出现异常黑线。要明确贫血类型，若是缺铁性贫血，遵医嘱服用硫酸亚铁片、富马酸亚铁颗粒、右旋糖酐铁分散片，多吃含铁丰富食物；巨幼细胞贫血可补充叶酸片、维生素B12片等。

日常要注意保护指甲，避免过度修剪和外力损伤，保持指甲清洁。同时，养成良好生活习惯，保证充足睡眠，适当运动，定期体检，关注指甲及身体整体健康状况，若黑色细线持续不消失或加重，应及时就医。